DigitalMicrographはGatan Inc.製品の制御・データ取得・解析に用いられるソフトウエアです。同社の製品群(TEM用カメラ・EELS装置・STEMシステム)で取得したデータは、.dm3などの拡張子で保存されます。TEM像、STEM像、Diffraction図形、EELSスペクトルなど様々な種類のデータが保存できます。*.dm3データには、Gatan製品や電子顕微鏡本体の諸条件(例えば倍率など)がタグ情報として含まれています。このテンプレートではFIJI [1,2] を利用し、タグ情報を読み出してRDEに登録します。
[1] : Schindelin, J., Arganda-Carreras, I., Frise, E., Kaynig, V., Longair, M., Pietzsch, T., … Cardona, A. (2012). Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nature Methods, 9(7), 676–682. https://doi.org/10.1038/nmeth.2019
[2] : Fiji https://fiji.sc/
開発協力者:木本 浩司(NIMS マテリアル基盤研究センター 先端解析分野 電子顕微鏡グループ)
登録可能ファイル
dm3ファイル
登録後のイメージ
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スペック
項目 | 説明 |
---|---|
用途 | Digital Micrograph dm3フォーマット |
実験装置の手法の名称 | STEM, TEM, EELS, diffraction(TED) |
ファイルを出力する実験装置の機種 | Titan cubed |
ファイルのフォーマット | Gatan Digital Micrograph(dm3) |
ファイルの拡張子 | dm3 |
メタデータの抽出方式 | ファイル内容からのメタデータ抽出 |
メタデータ抽出結果の標準メタへのマッピングの有無 | あり |
メタデータを記述する略語を判読性に優れた専門用語に変換する作業の有無 | あり |
メタデータのvariable構造の有無 | なし |
可視化の有無 | あり |
可視化の種類 | 画像 |
データ解析の有無 | あり |
データ解析の特徴 | コントラスト補正 |
データ登録方式 | インボイス |
データ入出力方式 | 1回のデータ登録操作で1ファイルから1タイルを生成 |
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DM3_format 1.0 [NIMS_DTx006]
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